271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3028 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  95.06 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  82.28 
 
 
167 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  79.5 
 
 
167 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  62.84 
 
 
159 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  60.27 
 
 
159 aa  184  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  57.23 
 
 
162 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  59.59 
 
 
159 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  63.19 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  58.97 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  53.42 
 
 
170 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  44.12 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  42.96 
 
 
158 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
155 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  44.06 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  42.65 
 
 
157 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  42.96 
 
 
159 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  42.36 
 
 
149 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  39.55 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  42.15 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  38.69 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  40.32 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  36.64 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  35.51 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  35.43 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  35 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
166 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  34.07 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  34.96 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.14 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  35.56 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.57 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  35.51 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.27 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.04 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  34.75 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  32.87 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  34.75 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  34.53 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  34.29 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  30.37 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  31.88 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.48 
 
 
216 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.86 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  32.8 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  32.61 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  34.53 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  34.53 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  33.59 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  32.8 
 
 
284 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  32.8 
 
 
285 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.04 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  35.46 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  31.25 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  31.91 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  34.07 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  32 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  34.07 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34.07 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.31 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  34.07 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.59 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.16 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.17 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  31.94 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>