280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  65.16 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  66.67 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  62.99 
 
 		 199 aa  213  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  62.18 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  62.18 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  62.18 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  61.04 
 
 		 182 aa  206  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  60.65 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  59.35 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  58.44 
 
 		 185 aa  192  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  55.35 
 
 		 169 aa  190  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  56.49 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  57.14 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  48.08 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  47.13 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.85 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.23 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.66 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  37.75 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.23 
 
 		 177 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  35.77 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.81 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.75 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  35 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.04 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  31.62 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  31.21 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  32.21 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.8 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.26 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  36.22 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  37.14 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  31.67 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.33 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  33.8 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  29.73 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  30.5 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  31.85 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  28.67 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  28.67 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  27.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  31.61 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  29.79 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  29.79 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  30.65 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  28.3 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  31.36 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  26.19 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  24.68 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  29.79 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  33.59 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  29.63 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  29.68 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  29.03 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4223  Ferritin Dps family protein  31.09 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.958952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>