More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3484 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 
163 aa  327  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  61.73 
 
 
163 aa  205  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  64.33 
 
 
188 aa  203  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  59.35 
 
 
177 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  50.32 
 
 
176 aa  160  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  57.46 
 
 
137 aa  160  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  51.61 
 
 
158 aa  151  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.28 
 
 
178 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.1 
 
 
181 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.53 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.53 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.53 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  52.85 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  44.37 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.56 
 
 
167 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.81 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  48.32 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  47.1 
 
 
179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.91 
 
 
167 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.26 
 
 
167 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  41.78 
 
 
160 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.27 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.27 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.27 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  47.26 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  48.84 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  32.7 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  36.36 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  36.31 
 
 
191 aa  89  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  30.82 
 
 
169 aa  87.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.66 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.75 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 
179 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  35.67 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  36.05 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  29.01 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.91 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  30.34 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  30.34 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  30.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  30.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  30.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  30.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  30.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  30.34 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  30.34 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  36.62 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  37.16 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.9 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  36.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  31.82 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  34.03 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  34.01 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  34.93 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  29.25 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  32.19 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  29.49 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  33.99 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  33.99 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  33.99 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  31.51 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  31.51 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  31.51 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  31.68 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  29.25 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>