More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1729 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  49.25 
 
 
162 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  47.45 
 
 
158 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  43.88 
 
 
155 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  43.88 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  47.86 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  44.06 
 
 
158 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  44.06 
 
 
157 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  51.13 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  42.75 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  43.48 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  44.6 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  39.86 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  43.75 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  41.8 
 
 
155 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  43.7 
 
 
167 aa  103  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  42.36 
 
 
162 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  42.36 
 
 
162 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  38.41 
 
 
159 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  43.36 
 
 
162 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  40.44 
 
 
170 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  40.54 
 
 
179 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  41.22 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  33.33 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  38.73 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  38.52 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  35.88 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.76 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  39.71 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  39.13 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.69 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  37.59 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  33.81 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  35.46 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  38.3 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  35.46 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.81 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  35.46 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.81 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  35.46 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.97 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  33.81 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  37.67 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.07 
 
 
188 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  34.07 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.65 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  32.64 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  34.29 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.82 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  33.81 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  33.81 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  30.94 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  33.78 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  33.64 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  32.09 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  30.22 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  38.69 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  32.09 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  32.09 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  31.85 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  31.85 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.88 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  31.36 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  31.36 
 
 
284 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  31.36 
 
 
286 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.99 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  30.94 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  31.34 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  30.94 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.85 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
182 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  26.5 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  26.5 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.37 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  31.65 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  33.33 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  25.83 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.85 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  30.5 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>