More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0800 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  61.73 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  55.62 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  56.69 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  49.07 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  59.26 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  51.95 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  51.85 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.62 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.62 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  57.72 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.1 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  46.98 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  46.1 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  44.65 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.16 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.61 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.21 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.61 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.61 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.61 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  44.22 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  43.14 
 
 		 179 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  45.07 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  45.07 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  33.12 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  32.47 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  35.06 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  34.42 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  36.71 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  30.86 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.64 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  32.69 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  34.87 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  36.91 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  32.89 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.12 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  35.66 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  36.48 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  29.45 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  29.45 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  34.03 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  35.57 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  28.77 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  28.77 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  28.28 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  32.69 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  28.28 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  35.57 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  30.67 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  34.23 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  27.78 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  28.77 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.03 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  28.77 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  28.77 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.03 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  33.94 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  28.77 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  28.77 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  36.17 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  28.48 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  35.44 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.08 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>