261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  81.82 
 
 		 190 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  74.73 
 
 		 185 aa  280  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  65.97 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  61.93 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  61.93 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  61.93 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  61.76 
 
 		 216 aa  218  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  60.82 
 
 		 182 aa  213  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  61.08 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  60.59 
 
 		 187 aa  207  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  57.89 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  56.8 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  57.14 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  48.05 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  47.1 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.24 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  37.31 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.77 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.77 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.49 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.49 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.49 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.38 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.16 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.38 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  38.14 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.94 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  35.61 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  33.79 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.7 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  36.88 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.25 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  29.61 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  30.34 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.15 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  29.09 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.15 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  31.67 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.61 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  33.76 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  27.16 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.51 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  32.99 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.12 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.27 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  31.5 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  30.17 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  30.5 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  28.4 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  28.4 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  28.75 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  25 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  27.81 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  29.6 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  27.81 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  27.81 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  30.13 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  27.78 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  29.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  27.63 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  29.41 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  27.78 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  30.38 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.51 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  28.4 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>