295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5160 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  82.14 
 
 
182 aa  292  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  84.24 
 
 
182 aa  291  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  65.09 
 
 
182 aa  234  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  61.93 
 
 
191 aa  226  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  58.19 
 
 
199 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  62.5 
 
 
190 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  59.66 
 
 
185 aa  219  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  62.11 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  62.18 
 
 
163 aa  210  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  56.1 
 
 
169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  54.37 
 
 
187 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  48.72 
 
 
159 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  45.22 
 
 
159 aa  147  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
167 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.9 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.31 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.26 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.26 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.26 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.26 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.26 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.9 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  37.09 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.22 
 
 
181 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.05 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  36.17 
 
 
158 aa  87  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.57 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.57 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.57 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  37.24 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  38.58 
 
 
137 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.41 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  34.87 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.57 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.51 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  34.57 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  37.7 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
155 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  34.09 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.09 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  30 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.99 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  30.52 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.99 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  31.16 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  31.88 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.85 
 
 
222 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  31.17 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  28.22 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  31.76 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.95 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.65 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  30.67 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  32.3 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  39.5 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  28.87 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  28.87 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  28.87 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  28.87 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  28.87 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  28.87 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  33.12 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  28.87 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  33.76 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  28.87 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.41 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  28.87 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  30.72 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>