47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3998 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  220  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  70.59 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  43.69 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  40.95 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  38.32 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  38.74 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  35.64 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  38.32 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  37.74 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.58 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  36.63 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.64 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  38.04 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  38.04 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  32.43 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  38.04 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  40.54 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  36.94 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  35.78 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  37.17 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  37.17 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  35.4 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  29.63 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  28.83 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  28.04 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  30.39 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  30.84 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  31.73 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  30.84 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  30.84 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  22.12 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  22.12 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  26.21 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  25.23 
 
 		 159 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  27.93 
 
 		 166 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  27.45 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  29.82 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.58 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  27.45 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.82 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  24.56 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  32.22 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  28.43 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  24.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  24.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  24.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  30.85 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>