296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02269 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  61.25 
 
 		 199 aa  213  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  59.63 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  56.79 
 
 		 185 aa  196  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  56.1 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  58.13 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  56.1 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  56.1 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  56.8 
 
 		 191 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  56.17 
 
 		 190 aa  194  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  54.6 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  55.35 
 
 		 163 aa  190  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  52.41 
 
 		 187 aa  187  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  55.62 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  47.13 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  45.39 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.91 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.96 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.35 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.99 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.96 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.96 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.96 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.36 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.74 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.74 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.74 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.74 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.74 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.54 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  34.64 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  33.11 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.52 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.72 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  34.18 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.72 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  32.67 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.82 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  37.96 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  32.7 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  35.1 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.32 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  35.51 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  35.51 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  35.51 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.62 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  33.59 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.93 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  29.73 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  32.23 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.85 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.06 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  30.86 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  29.52 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  27.85 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  35.61 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  29.2 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  30.65 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  33.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  27.06 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  26.97 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  31.4 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  26.95 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  26.95 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.82 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  29.48 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  26.58 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  26.71 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  29.31 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  26.58 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  28.97 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  28.97 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  28.97 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  28.97 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  28.97 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>