More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2149 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
158 aa  330  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  70.06 
 
 
157 aa  235  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  68.79 
 
 
157 aa  229  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  55.84 
 
 
156 aa  174  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  48.05 
 
 
175 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  48.05 
 
 
175 aa  155  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  43.23 
 
 
179 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  45.81 
 
 
157 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  42.58 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  44.52 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  42.86 
 
 
161 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  43.87 
 
 
157 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  42.21 
 
 
161 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  41.94 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  43.04 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  44.16 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  43.79 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  44.16 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  42.11 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  43.51 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  42.11 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  42.21 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  42.21 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  42.86 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  42.86 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  43.05 
 
 
162 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  42.86 
 
 
156 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  43.05 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  43.05 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  43.05 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  43.05 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  44.37 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  43.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  42.38 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  42.38 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  42.38 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  42.76 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 
168 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  40.52 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  40.79 
 
 
151 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  42 
 
 
165 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  40.51 
 
 
157 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  42.21 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  40.51 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  40.91 
 
 
157 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  39.61 
 
 
168 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  41.56 
 
 
158 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  40.4 
 
 
172 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 
174 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  40.4 
 
 
172 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  43.62 
 
 
166 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  40.91 
 
 
156 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  40.91 
 
 
156 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  41.18 
 
 
175 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  41.72 
 
 
155 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  40.4 
 
 
174 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  40.51 
 
 
157 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  39.33 
 
 
201 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  37.66 
 
 
166 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  43.79 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  41.72 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  41.72 
 
 
155 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  39.1 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  40.4 
 
 
163 aa  117  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  39.74 
 
 
160 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  40.4 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  40.4 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  39.07 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  40.91 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  41.06 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  39.07 
 
 
165 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  39.74 
 
 
155 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  39.74 
 
 
155 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  39.74 
 
 
155 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  37.91 
 
 
181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  40.67 
 
 
160 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  38.56 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  37.42 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  40.25 
 
 
159 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  37.42 
 
 
182 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  39.22 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  39.07 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  38.56 
 
 
156 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  36.77 
 
 
180 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  39.07 
 
 
170 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  36.08 
 
 
161 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  38.56 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  38.19 
 
 
158 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  38.19 
 
 
158 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  41.18 
 
 
157 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  33.77 
 
 
168 aa  101  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  38.3 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  38.3 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  37.76 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>