More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1767 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  53.64 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  51.7 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  49.66 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.99 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  51.03 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  49.66 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.99 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  47.3 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  53.33 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  52 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  52 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  50 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46 
 
 		 167 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  47.68 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.67 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.48 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  44.52 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.33 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.97 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.97 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.97 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  37.2 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  32.05 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  37.96 
 
 		 179 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  36.92 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.97 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  35.48 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  35.26 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  35.26 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.84 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  36.36 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  29.33 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.48 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.48 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.06 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.42 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  33.11 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.21 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  26.62 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.48 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  32.47 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  30.26 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  28.28 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  30.97 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  31.85 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  30.97 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  34.42 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  27.08 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  34.42 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  34.42 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  34.42 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  34.42 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  34.42 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  28.95 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  30.92 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  29.49 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  30 
 
 		 204 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>