299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3912 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
160 aa  320  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  51.59 
 
 
165 aa  175  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.65 
 
 
163 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  45.91 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.34 
 
 
181 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.21 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.21 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.21 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.21 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.21 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.31 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  51.61 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.11 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.83 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.67 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  44.94 
 
 
158 aa  127  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.33 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  47.01 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.68 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.76 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.27 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.76 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.76 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.67 
 
 
165 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46 
 
 
165 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46 
 
 
165 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.33 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.33 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
164 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  39.33 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  39.86 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  34.64 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  37.84 
 
 
179 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  39.84 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  33.99 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  33.99 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  33.99 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  37.76 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.89 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  31.85 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  33.08 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.88 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  30.38 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  35.61 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  30.72 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  32.3 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  24.11 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  31.01 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  31.85 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  28.1 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  31.85 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  31.76 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  28.06 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  27.01 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  31.94 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.19 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  26.8 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  28.1 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  29.45 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  26.14 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.38 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  29.14 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  28.26 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  29.68 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  30.38 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  30.97 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  30.97 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  29.8 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  33.61 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  29.45 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  36.59 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  27.74 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  28.86 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>