271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0554 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  100 
 
 
155 aa  321  2e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  45.03 
 
 
155 aa  151  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  44.67 
 
 
160 aa  147  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  43.24 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2311  non-heme iron-binding ferritin  41.89 
 
 
148 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0371434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  32.14 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  32.14 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  32.14 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
146 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 
146 aa  90.9  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  30.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  29.08 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  31.91 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  30.71 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A05  DNA-binding ferritin-like protein  27.33 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  28.06 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  29.45 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  26.39 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  29.11 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  25.36 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.81 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  30 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.06 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  26.32 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  24.48 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  24.83 
 
 
178 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  24.64 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.56 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.13 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  27.52 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  24.14 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  26.23 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  26.35 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  28.38 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  26.85 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  26.39 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  28.26 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  24.26 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  23.74 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  26.9 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  27.15 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  25.71 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  26.06 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  26.06 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  26.21 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  27.14 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  28.38 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  25.83 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.43 
 
 
188 aa  57.4  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  27.87 
 
 
178 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  28.97 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  30 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  23.57 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  26.9 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  26.23 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  25.36 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.08 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4223  Ferritin Dps family protein  28.78 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.958952  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  29.2 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  25.52 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  25.52 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  26.4 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  25.52 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  26.62 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.45 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.45 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  28.15 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  23.45 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  27.34 
 
 
176 aa  54.3  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  23.84 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  26.81 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  27.03 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  26.9 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.85 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  24.46 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  27.48 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>