272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1705 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0248  conserved hypothetical protein, putative bacterioferritin  81.21 
 
 
149 aa  263  8e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  59.15 
 
 
145 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  52.48 
 
 
144 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  56.03 
 
 
145 aa  141  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  48.94 
 
 
145 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  37.76 
 
 
145 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  38.03 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  38.35 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  38.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  38.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  38.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  38.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  38.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  38.64 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  38.64 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  38.64 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  37.4 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  27.78 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  36.22 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  28.67 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  30.99 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  30.82 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  29.45 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  31.03 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  32.64 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  32.64 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  27.89 
 
 
174 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  28.17 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  31.94 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  31.94 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  32.33 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  30.28 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  32.56 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  30.77 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  29.45 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  29.45 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  29.45 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  27.78 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  27.08 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  31.78 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  28.28 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  30.07 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  29.17 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  29.08 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  29.37 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.77 
 
 
168 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  30.33 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  29.17 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  31.47 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  30.65 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  28.47 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  28.28 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  28.28 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  28.67 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  28.47 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  28.67 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  28.89 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  31.06 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  28.37 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>