278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0080 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0248  conserved hypothetical protein, putative bacterioferritin  64.79 
 
 
149 aa  193  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  62.76 
 
 
144 aa  185  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  59.15 
 
 
149 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  59.15 
 
 
149 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  53.79 
 
 
145 aa  148  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  44.83 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  31.51 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  37.24 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  34.48 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  34.97 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  34.97 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  34.03 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  34.27 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  34.03 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  34.27 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  34.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  28.08 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  28.86 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  31.25 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  32.64 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  28.08 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  32.17 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.91 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.77 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  34.01 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  29.58 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  32.64 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  32.64 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  28.17 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  31.47 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  26.24 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  30.77 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  32.86 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  32.19 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  29.37 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  31.21 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  30.07 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  29.08 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  29.58 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  28.17 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  30.28 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  30.94 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  26.95 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  29.25 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  30.22 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  30.22 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  30.22 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  26.95 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  27.66 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  26.95 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  30.22 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  26.95 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0711  neutrophil activating protein A (napA)  28.36 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  29.58 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  27.89 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>