275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0248 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0248  conserved hypothetical protein, putative bacterioferritin  100 
 
 		 149 aa  306  6.999999999999999e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  81.21 
 
 		 149 aa  263  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  81.21 
 
 		 149 aa  263  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  64.79 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  54.61 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  58.16 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  46.81 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  39.23 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  37.69 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  37.69 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  37.69 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  36.8 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  30.56 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  27.59 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  36 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  30.71 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  30.56 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  36.8 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  31.78 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  30.28 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  30.56 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  31.54 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 		 175 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  28.47 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  29.25 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  31.11 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  29.25 
 
 		 174 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  31.69 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  31.69 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  32.19 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  29.53 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  30.22 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  27.08 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  27.01 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  31.94 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  31.21 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  27.01 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.94 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  32.31 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  32.31 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  30.5 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.61 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  29.79 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.83 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  33.79 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  33.79 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  33.79 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  31.11 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  33.79 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  32.31 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  29.66 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  32.31 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  29.79 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  31.51 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  28.08 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  26.28 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  28.38 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  29.63 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  29.58 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  31.51 
 
 		 180 aa  66.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>