More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0735 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  377  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  99.44 
 
 
180 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  75.14 
 
 
181 aa  288  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  74.39 
 
 
182 aa  270  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  65.16 
 
 
161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  62.89 
 
 
158 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  62.28 
 
 
165 aa  210  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  60.74 
 
 
166 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  63.52 
 
 
162 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  61.68 
 
 
165 aa  208  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  61.31 
 
 
168 aa  208  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  64.52 
 
 
161 aa  207  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  60.12 
 
 
166 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  62.26 
 
 
158 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  64.1 
 
 
156 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  62.18 
 
 
160 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  62.58 
 
 
164 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  59.39 
 
 
163 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  61.15 
 
 
156 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  61.78 
 
 
175 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  62.82 
 
 
156 aa  202  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  59.38 
 
 
165 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  58.9 
 
 
174 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  61.29 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  63.23 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  62.58 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  59.75 
 
 
164 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  61.29 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  55.06 
 
 
201 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  60.13 
 
 
160 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  60.65 
 
 
162 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  60.65 
 
 
162 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  60.65 
 
 
162 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  58.86 
 
 
172 aa  200  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  58.86 
 
 
172 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  54.6 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  63.46 
 
 
156 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  63.46 
 
 
156 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  60.26 
 
 
156 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  58.97 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  58.97 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  62.59 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  60.9 
 
 
163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  58.86 
 
 
165 aa  195  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  60.39 
 
 
158 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  58.44 
 
 
155 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  60 
 
 
157 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  56.1 
 
 
166 aa  191  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  60 
 
 
157 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  60 
 
 
157 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  60 
 
 
157 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  56.33 
 
 
188 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  57.59 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  180  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  56.13 
 
 
155 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  56.77 
 
 
155 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  56.41 
 
 
159 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  57.05 
 
 
160 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  55.77 
 
 
155 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  53.16 
 
 
157 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  51.9 
 
 
157 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  51.28 
 
 
156 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  52.56 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  50.64 
 
 
156 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  50.94 
 
 
156 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  49.67 
 
 
161 aa  154  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  45.81 
 
 
155 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  47.13 
 
 
159 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  45.39 
 
 
168 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  47.17 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  47.17 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  40.62 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  40.38 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  38.12 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  39.1 
 
 
175 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
157 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  38.46 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  39.13 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  41.56 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  39.35 
 
 
151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  40.3 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  40.3 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 
179 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.13 
 
 
170 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  35.8 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  36.77 
 
 
158 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  39.49 
 
 
157 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  38.71 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>