More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1985 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  100 
 
 		 168 aa  346  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  51.68 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  51.01 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  51.68 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  47.2 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  47.2 
 
 		 162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  50.67 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  50.67 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  47.2 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  47.2 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  47.2 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  51.33 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  50.34 
 
 		 157 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  50.34 
 
 		 157 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  47.2 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  47.2 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  49.32 
 
 		 155 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  50.34 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  50.34 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  51.68 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  50.34 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  50.34 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  48.67 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  45.51 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  50.67 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  50.67 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  47.65 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  46.31 
 
 		 163 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  44.87 
 
 		 161 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  47.26 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  49.33 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  47.65 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  50 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  45.33 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  45.33 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  43.51 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  46.62 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  44.1 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  45.62 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  43.9 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  46.98 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  44.72 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  44.72 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  52.45 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  52.45 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  45.75 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  50 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  50 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  46.05 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  45.64 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  45.57 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  44.67 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  44.22 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  43.48 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  43.62 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  45.39 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  44 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  43.14 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  43.33 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  42.86 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  43.62 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  42.76 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  43.42 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  42.18 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  45.71 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  45.71 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  40.36 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  44 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  42.67 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  42.38 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  38 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  41.5 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  47.1 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  42 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  43.71 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  43.06 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  43.06 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  41.06 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  37.42 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  42.03 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  40.76 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  41.79 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  42.65 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  39.22 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  34.62 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>