272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0992 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0248  conserved hypothetical protein, putative bacterioferritin  58.16 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  53.79 
 
 
145 aa  165  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1705  bacterioferritin, putative  56.03 
 
 
149 aa  163  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1519  bacterioferritin, putative  56.03 
 
 
149 aa  163  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  52.41 
 
 
144 aa  147  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  44.83 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  38.57 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  38.85 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  38.85 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  38.13 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  38.85 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  35.46 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  38.13 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  38.13 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  38.13 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  38.41 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  38.13 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  38.13 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  34.27 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  33.79 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  33.79 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.1 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  35.17 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  33.79 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  35.17 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  29.2 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  31.69 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  32.17 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  31.47 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  28.67 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  31.47 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.37 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.86 
 
 
170 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 
165 aa  77  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  33.57 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  28.47 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  31.47 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  30 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  30.07 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  31.43 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  25.87 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  29.37 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  34.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  34.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  34.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  34.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  31.94 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  28.78 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  31.94 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  28.26 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  34.29 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  34.29 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  34.29 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  34.29 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  34.29 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  34.27 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  31.72 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  26.57 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>