283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2311 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2311  non-heme iron-binding ferritin  100 
 
 		 148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0371434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  54.42 
 
 		 173 aa  173  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  42.18 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  41.89 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  39.29 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  38.46 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  38.46 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  38.46 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  37.84 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  37.84 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  37.76 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  37.76 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  37.76 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  37.76 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  37.76 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  37.76 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  34.53 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  32.61 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  32.61 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  32.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  32.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  32.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  32.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  32.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  32.61 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  32.61 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.65 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  32.61 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  30.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  31.43 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.97 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  28.17 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.28 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.87 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.43 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.87 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.94 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.25 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.25 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  33.61 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  32.8 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.58 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.57 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  30.4 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  34.13 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  31.51 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  29.79 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.57 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  32.8 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  29.6 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  29.58 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  30.33 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  31.65 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.14 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.09 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  31.4 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  28.81 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  29.66 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  31.16 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  28.26 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  30.25 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0080  starvation-inducible DNA-binding protein Dps  29.79 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  30.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  30.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.17 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  31.15 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>