More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0281 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  32.93 
 
 
178 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 
179 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  38.03 
 
 
155 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
175 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  33.77 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  36.67 
 
 
164 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  31.72 
 
 
175 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
175 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  33.79 
 
 
168 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  30.2 
 
 
156 aa  85.1  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1007  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
159 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000417109  normal  0.0215471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  30.34 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  34.84 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  32.33 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  30.2 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  30.43 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.18 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  28.67 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  32.68 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
166 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  33.33 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  33.33 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  33.97 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.33 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  32.45 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  32.45 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  31.17 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  32.45 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34 
 
 
157 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  33.54 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.12 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  31.76 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  33.57 
 
 
159 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  32.89 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2366  Ferritin and Dps  32.62 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.79 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  30.2 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.79 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  32.48 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  29.11 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  30.46 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  31.61 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  31.61 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  31.65 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  30.51 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 
162 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  30.26 
 
 
179 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  35.46 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  29.8 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  30.32 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  28.51 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.51 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  31.79 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  29.75 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  32.88 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  31.85 
 
 
179 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  31.85 
 
 
179 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  31.85 
 
 
179 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
155 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>