297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3834 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  93.1 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  85.71 
 
 		 175 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  80 
 
 		 175 aa  306  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  76.4 
 
 		 178 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  77.71 
 
 		 175 aa  286  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  73.74 
 
 		 179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  66.24 
 
 		 168 aa  236  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  64.1 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  58.58 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  61.15 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  58.52 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  56.89 
 
 		 173 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  57.99 
 
 		 175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  57.4 
 
 		 175 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  61.54 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  57.4 
 
 		 175 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3717  Ferritin and Dps  59.26 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0194969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  62.42 
 
 		 180 aa  207  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  56.21 
 
 		 172 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1521  Ferritin Dps family protein  57.76 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  55.42 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  53.49 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  56.1 
 
 		 199 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  56.1 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  55.41 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  50 
 
 		 213 aa  187  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3910  Ferritin Dps family protein  52.35 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2366  Ferritin and Dps  51.82 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2646  Ferritin and Dps  48.51 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  37.41 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  37.41 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  37.41 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  36.55 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  36.23 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  36.23 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  36.23 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  35.82 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  35.82 
 
 		 157 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  35.82 
 
 		 157 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  36.69 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.69 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  36.69 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  35.25 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  35.97 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  33.81 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.53 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  35.1 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  34.53 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  34.06 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.85 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  35.97 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.72 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  34.33 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  34.33 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  33.12 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  31.65 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34.06 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.09 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 		 159 aa  84.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  32.14 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  28.87 
 
 		 157 aa  84.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.53 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  33.08 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  34.53 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  32.47 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  32.37 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  31.51 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  33.81 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  32.37 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  32.43 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  32.37 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  32.94 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  31.65 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  33.09 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>