283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1191 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
181 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  69.77 
 
 
177 aa  260  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  73.25 
 
 
172 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  73.72 
 
 
172 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  69.87 
 
 
171 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  66.05 
 
 
173 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  68.35 
 
 
172 aa  227  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  66.46 
 
 
175 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3717  Ferritin and Dps  60.23 
 
 
181 aa  226  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0194969  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  66.46 
 
 
175 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1521  Ferritin Dps family protein  64.42 
 
 
173 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  61.63 
 
 
175 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  64.1 
 
 
199 aa  220  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  63.64 
 
 
175 aa  220  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3910  Ferritin Dps family protein  65.22 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  61.49 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  63.46 
 
 
178 aa  218  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  60.23 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  62.96 
 
 
180 aa  217  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  60.48 
 
 
175 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  64.1 
 
 
175 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  61.35 
 
 
179 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  64.74 
 
 
175 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  59.01 
 
 
168 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  57.69 
 
 
185 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  54.32 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  55 
 
 
164 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  45.62 
 
 
213 aa  157  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2366  Ferritin and Dps  49.64 
 
 
151 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2646  Ferritin and Dps  44.85 
 
 
151 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  35.51 
 
 
155 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  94.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  34.78 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  32.85 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  34.78 
 
 
162 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  34.06 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  32.61 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  34.06 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  32.85 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  32.85 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  32.85 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  33.33 
 
 
165 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  34.06 
 
 
166 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  32.85 
 
 
156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  32.72 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  35 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
156 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  33.81 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  34.31 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.61 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  32.85 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.12 
 
 
157 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.12 
 
 
157 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  31.43 
 
 
161 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  30.34 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  32 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  31.43 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  32.61 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  32.61 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  30.71 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  31.39 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  30.66 
 
 
159 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.07 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  28.47 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  32.86 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  31.43 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  30.14 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  28.97 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  36.5 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  30.94 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>