291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2646 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2646  Ferritin and Dps  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  54.97 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2366  Ferritin and Dps  59.86 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  48.28 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  46.94 
 
 
171 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  50.74 
 
 
177 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  47.26 
 
 
175 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  47.59 
 
 
172 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  46 
 
 
199 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  50 
 
 
179 aa  139  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  48.51 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  47.76 
 
 
175 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  44.85 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  44.67 
 
 
196 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  46.1 
 
 
213 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  42.07 
 
 
175 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  47.76 
 
 
178 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  42.07 
 
 
175 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  43.15 
 
 
173 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  45.03 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3910  Ferritin Dps family protein  41.55 
 
 
177 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  43.15 
 
 
168 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  45.65 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  46.27 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  41.5 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  43.92 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  46.1 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1521  Ferritin Dps family protein  46.51 
 
 
173 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 
180 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3717  Ferritin and Dps  43.24 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0194969  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  36.24 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
188 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  36.81 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  36.11 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  36.24 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  36.24 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  36.24 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  36.24 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  35.06 
 
 
155 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  35.71 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  35.71 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  36.03 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  37.76 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  36.91 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  35.57 
 
 
181 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  35.14 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.57 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  36.11 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  35.57 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  34.01 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.67 
 
 
163 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  34.23 
 
 
161 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 
165 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  34.51 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  34.29 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.72 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  36.3 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  34.03 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.46 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  36.23 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  33.8 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  32.19 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>