296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4157 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  55.88 
 
 
177 aa  208  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  55.76 
 
 
168 aa  207  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  54.34 
 
 
178 aa  207  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  57.69 
 
 
181 aa  207  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  53.76 
 
 
175 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  55.56 
 
 
179 aa  201  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3717  Ferritin and Dps  58.02 
 
 
181 aa  201  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0194969  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  56.65 
 
 
175 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  55.17 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  56.07 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  55.7 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  58.49 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  53.49 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3910  Ferritin Dps family protein  50.87 
 
 
177 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  55.28 
 
 
172 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  49.13 
 
 
175 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  50.31 
 
 
172 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  49.13 
 
 
175 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  55.77 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  54.49 
 
 
199 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  51.23 
 
 
175 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1521  Ferritin Dps family protein  52.8 
 
 
173 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  49.08 
 
 
172 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  53.85 
 
 
196 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  52.29 
 
 
173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  50 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  45.4 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2366  Ferritin and Dps  47.45 
 
 
151 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2646  Ferritin and Dps  45 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  39.42 
 
 
155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  41.01 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  38.13 
 
 
164 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  38.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  38.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  38.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  38.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  38.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  40.29 
 
 
166 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  38.85 
 
 
166 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  36.69 
 
 
175 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  37.41 
 
 
157 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  38.13 
 
 
162 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  37.41 
 
 
157 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  36.55 
 
 
163 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  38.57 
 
 
157 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  38.57 
 
 
157 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  38.57 
 
 
157 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  38.3 
 
 
158 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  37.41 
 
 
156 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  38.13 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  37.41 
 
 
156 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  36.69 
 
 
165 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  36.69 
 
 
157 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  35.19 
 
 
168 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 
155 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  37.41 
 
 
162 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  36.5 
 
 
174 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  35.97 
 
 
165 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
155 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.96 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.48 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  37.68 
 
 
160 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  35.04 
 
 
155 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
158 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  35.77 
 
 
156 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 
160 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
158 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  36.23 
 
 
156 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  35.04 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  35.04 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  34.97 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  35.97 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  32.75 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  34.31 
 
 
165 aa  94.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  33.58 
 
 
159 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 
166 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  31.71 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  31.43 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  36.5 
 
 
156 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  36.5 
 
 
156 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
161 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  33.77 
 
 
163 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>