288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0536 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
181 aa  360  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  85.64 
 
 
181 aa  310  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0390  Ferritin Dps family protein  72.22 
 
 
182 aa  234  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.157325  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  67.4 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  67.22 
 
 
182 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  64.64 
 
 
181 aa  221  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  62.22 
 
 
182 aa  220  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2289  Ferritin Dps family protein  67.04 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0638834  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0173  Ferritin Dps family protein  43.1 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0172  Ferritin Dps family protein  47.06 
 
 
193 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  41.67 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4372  Ferritin Dps family protein  42.05 
 
 
176 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.156567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  42.42 
 
 
175 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  37.57 
 
 
183 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  37.57 
 
 
183 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  37.02 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  38.04 
 
 
184 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  36.36 
 
 
184 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  39.16 
 
 
176 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  35.44 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  30.97 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  32.24 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  34.18 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.17 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  32.26 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2165  Ferritin Dps family protein  39.71 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000673209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  31.06 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  28.57 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  28.57 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  31.58 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  31.69 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.33 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  32.67 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  27.5 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.09 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  27.5 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  27.15 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  29.93 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  27.5 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  27.5 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  27.5 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  30.82 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  29.63 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  32.39 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  40 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  30.97 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  29.1 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  33.58 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  28.89 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  27.5 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  32.28 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  32 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  27.21 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  32.21 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  27.21 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  27.94 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  32.09 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  28.17 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  29.66 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  29.66 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  29.66 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  29.2 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  29.66 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  29.66 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  29.66 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  27.14 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  29.66 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  29.66 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  27.68 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  29.66 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  29.61 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  27.68 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  31.03 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  31.72 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  27.65 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  30.34 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  28.89 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>