258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0943 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  37.8 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  39.24 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  38.36 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  36.81 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  39.24 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  39.24 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4372  Ferritin Dps family protein  40.91 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.156567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  36.81 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  36.31 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  37.34 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2165  Ferritin Dps family protein  38.31 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000673209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  39.47 
 
 		 184 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  35.44 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0173  Ferritin Dps family protein  34.91 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2289  Ferritin Dps family protein  34.81 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0638834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0390  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.157325  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  30.94 
 
 		 159 aa  72  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0172  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  28.75 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  32.98 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  27.92 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  29.76 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  24.36 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  28.3 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  29.63 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  31.11 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  29.51 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  31.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  26.54 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  27.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  24.48 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  27.33 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  27.27 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  27.5 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  28.66 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  26.62 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  26.92 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  27.39 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  25.97 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  29.56 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  27.04 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  27.5 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  23.38 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  26.67 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  26.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  29.22 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  27.27 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  29.25 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  24.84 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  26.14 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0992  DNA protection during starvation protein  28.57 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  27.81 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  28.03 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  28.03 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  28.03 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  28.36 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.87 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  27.15 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  27.15 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  27.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  25.45 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  26.53 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  27.61 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  26.28 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  28.79 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  28.1 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  28.39 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  28.39 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  28.39 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  25.74 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  25.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  26.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  25.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>