More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2692 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  76.5 
 
 
196 aa  303  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  76.5 
 
 
197 aa  296  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  54.64 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  34.64 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.18 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.69 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.31 
 
 
163 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
180 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.71 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.9 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  33.33 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  35.14 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  35.81 
 
 
162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.81 
 
 
162 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.81 
 
 
162 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  34.19 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.55 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  33.55 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.55 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4372  Ferritin Dps family protein  32.9 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.156567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  32.91 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.19 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1007  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000417109  normal  0.0215471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  30.72 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  38.06 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  35.14 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  35.71 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  32.05 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  32.69 
 
 
161 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  32.47 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  33.78 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  33.78 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  32.26 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  34.46 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  34.46 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  34.46 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  34.46 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.26 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  32.43 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  31.61 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 
175 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
161 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  31.79 
 
 
166 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  33.78 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  33.78 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  33.78 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  33.78 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  33.78 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  33.55 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  32.85 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  32.85 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  32.37 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  32.45 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  30.72 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  31.37 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  32.03 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  32.12 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  32.03 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  32.12 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  29.07 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3717  Ferritin and Dps  34.44 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0194969  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  32.93 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.78 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  31.37 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>