280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2487 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  77.25 
 
 
167 aa  270  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  76.65 
 
 
167 aa  270  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  74.85 
 
 
167 aa  262  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  71.86 
 
 
167 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  69.46 
 
 
167 aa  254  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  69.46 
 
 
167 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  69.46 
 
 
167 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.86 
 
 
167 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.26 
 
 
167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.26 
 
 
167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.26 
 
 
167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.26 
 
 
167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  71.26 
 
 
167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  57.79 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  57.79 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  57.79 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 
181 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.7 
 
 
178 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  49.36 
 
 
164 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  41.92 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.16 
 
 
163 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.81 
 
 
163 aa  127  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  46.67 
 
 
157 aa  124  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  43.33 
 
 
160 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  43.24 
 
 
165 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.49 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  41.18 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  44.7 
 
 
137 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.12 
 
 
188 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  40.91 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  37.09 
 
 
158 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  34.42 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  39.23 
 
 
163 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  33.77 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  34.52 
 
 
199 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  31.82 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.77 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  29.49 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  31.54 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.38 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  32.33 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  31.58 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  32.68 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  32.03 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  28.67 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  28.67 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2311  non-heme iron-binding ferritin  31.65 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0371434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  34.31 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  30.14 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  31.11 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  25.9 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  31.85 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  30.32 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  32.85 
 
 
149 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  27.27 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  31.34 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  29.33 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  33.09 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.22 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  31.16 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  29.63 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  31.88 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  26.06 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  26.09 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  26.09 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  26.09 
 
 
146 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  26.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  26.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  26.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  26.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  26.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  25.69 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  25.69 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  31.51 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  27.74 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  24.29 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  24.65 
 
 
147 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  24.65 
 
 
147 aa  61.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>