261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0470 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 159 aa  316  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  73.72 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  59.24 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  54.84 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  53.29 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  50.66 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  50.67 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  52.32 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  51.32 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  43.97 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  45.93 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  44.44 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  45.19 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  43.48 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  44.6 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  48.55 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  43.7 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  42.65 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  42.96 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  42.96 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  41.48 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  42.28 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  40.91 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  38.52 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  36.49 
 
 		 199 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  34.87 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  34.87 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  34.87 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 		 187 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.58 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  34.21 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  36.62 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.31 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  36.18 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.03 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.3 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.9 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  34.27 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  34.9 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.78 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  37.74 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.78 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  30.43 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  34.17 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  34.17 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  34.17 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  33.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  30.61 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  31.08 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  34.09 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.01 
 
 		 188 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  33.05 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  31.58 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  33.86 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  34.56 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.97 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.89 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  35 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  30.66 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  30.13 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.54 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.54 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.41 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.66 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.75 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  32.77 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  28.57 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.05 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.2 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  29.8 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.39 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  30.77 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  25.33 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  25.83 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  30.77 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  30.77 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>