260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3536 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  76.77 
 
 		 155 aa  247  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  54.55 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  54.61 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  55.33 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  53.29 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  55.56 
 
 		 155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  48.68 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  56.86 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  43.88 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  43.8 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  42.54 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  45.26 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  42.34 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  41.04 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  44.54 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  39.55 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  39.55 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  38.81 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  38.06 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  39.55 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  38.51 
 
 		 216 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  36.55 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  38.81 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  36.57 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.21 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.31 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.21 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.62 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  31.82 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  35.64 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  30.32 
 
 		 178 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  30.52 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  30.52 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  30.52 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  31.17 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  30.32 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  29.73 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  30.53 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.54 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  28.89 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  40.48 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  27.91 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  29.63 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  27.81 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.48 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.41 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.48 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  28.57 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  24.17 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  28.57 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  24.17 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  27.7 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  29.53 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  28.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  28.19 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.81 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  28.19 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  28.19 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  28.19 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  29.87 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0711  neutrophil activating protein A (napA)  23.39 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  28.89 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  25.62 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.15 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.15 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.15 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  28.47 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.15 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>