237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0218 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  67.84 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  64.04 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  64.04 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  64.04 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  62.71 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  65.27 
 
 		 182 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  65.16 
 
 		 163 aa  216  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  58.1 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  59.06 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  60.49 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  57.3 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  59.63 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  56.55 
 
 		 187 aa  203  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  49.68 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  46.05 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  85.9  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.04 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.8 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  37.04 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  36.62 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  34.01 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.56 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  34.17 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.69 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  32.05 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.58 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.58 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.58 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.25 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  31.41 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.14 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  31.41 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  35.43 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  28.95 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.94 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  30.33 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  28.1 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  30.63 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  28.47 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  34.9 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  34.9 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  30.66 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.1 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.1 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  26.95 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.1 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  31.97 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  25.48 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  30.95 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  30.88 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  28.95 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  30.25 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  25.43 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  31.75 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  28.67 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  27.63 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  28.67 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  28.67 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  28.67 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  26.19 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  30.95 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  28.67 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  28.67 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  27.92 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.85 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  28.67 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  30.43 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  28.67 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>