54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1400 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  100 
 
 
154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  79.87 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  77.42 
 
 
157 aa  244  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  77.55 
 
 
156 aa  231  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  61.49 
 
 
153 aa  190  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  56.29 
 
 
153 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  56.74 
 
 
154 aa  168  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  56.74 
 
 
154 aa  168  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  50.35 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5174  Ferritin Dps family protein  50.35 
 
 
144 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  50.35 
 
 
144 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  50.35 
 
 
144 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  48.23 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  48.23 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  48.94 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  27.63 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  28.08 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
181 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  24.48 
 
 
194 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  26.57 
 
 
257 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  26.57 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  25.87 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  27.46 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  25.52 
 
 
192 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  27.46 
 
 
177 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  27.08 
 
 
176 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  27.27 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  26.57 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  25.23 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  26.76 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  28.17 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.88 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  25.36 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  23.85 
 
 
275 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  25 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  25.74 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  24.31 
 
 
275 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  26.92 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  24.24 
 
 
275 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  29.41 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>