195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0147 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  97.3 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  68.6 
 
 		 187 aa  263  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  68.82 
 
 		 177 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  68.24 
 
 		 177 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  69.19 
 
 		 192 aa  248  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  67.05 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  69.05 
 
 		 176 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  63.54 
 
 		 196 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  67.46 
 
 		 176 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  66.86 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  68.48 
 
 		 168 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  67.26 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  67.21 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  64.12 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  65.29 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  64.88 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  67.98 
 
 		 190 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  61.99 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  62.72 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  57.92 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  59.88 
 
 		 181 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  59.88 
 
 		 181 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  56.42 
 
 		 186 aa  207  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  62.03 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  58.43 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  55.62 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  51.45 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  37.36 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  34.72 
 
 		 164 aa  87.8  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.89 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  35.21 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  33.8 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.51 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  33.8 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  31.25 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  28.87 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.82 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  27.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  27.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  27.46 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  28.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  32.62 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  31.65 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  33.58 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.17 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  31.82 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  29.5 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  31.65 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  33.09 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  30.28 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  27.07 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  26.57 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  27.08 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  26.39 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  30.88 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  30.71 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  28.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  30.5 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  30.83 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  31.03 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  29.08 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  30.43 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  33.57 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  27.46 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  31.97 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  29.37 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  26.21 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  26.87 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  29.5 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  29.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  26.24 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  30.66 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1078  ferritin:bacterioferritin  27.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000658417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  29.17 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  29.71 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  31.62 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  29.37 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  31.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  31.11 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  29.17 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  31.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>