184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3513 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  91.07 
 
 
184 aa  310  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  78.11 
 
 
186 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  69.59 
 
 
194 aa  243  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  62.05 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  58.33 
 
 
187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  59.88 
 
 
185 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  59.88 
 
 
185 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  59.89 
 
 
192 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  59.28 
 
 
181 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  59.64 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  59.28 
 
 
176 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  60.49 
 
 
168 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  58.08 
 
 
180 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  58.68 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  57.83 
 
 
177 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  57.56 
 
 
176 aa  197  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  57.14 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  56.4 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  53.76 
 
 
196 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  57.32 
 
 
181 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  56.79 
 
 
174 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  52.94 
 
 
186 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  56.29 
 
 
190 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  56.89 
 
 
190 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  50.62 
 
 
257 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  46.63 
 
 
187 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
182 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 
164 aa  95.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  37.67 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  36.36 
 
 
164 aa  94.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  34.25 
 
 
164 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  36.11 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 
164 aa  92  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  34.93 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 
165 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  32.12 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  35.29 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.41 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  32.61 
 
 
275 aa  60.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  28.48 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  28.67 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  31.87 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  27.82 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  27.63 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  31.37 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  29.86 
 
 
275 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  31.16 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  30.88 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  27.27 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  27.48 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  32.61 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.88 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  30.94 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  31.21 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  31.16 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  28.78 
 
 
151 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  29.41 
 
 
159 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  33.57 
 
 
155 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  30.88 
 
 
275 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  31.88 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  28.26 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  26.57 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  24.29 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  31.88 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.88 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  25.47 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  25.47 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  24.82 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  31.43 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  26.24 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  26.24 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  30.88 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  26.28 
 
 
307 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  29.41 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  29.71 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  31.43 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  28.68 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  22.86 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  33.08 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  25.37 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  31.62 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>