150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0092 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 164 aa  340  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  89.02 
 
 		 164 aa  313  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  85.98 
 
 		 165 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  85.8 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  82.32 
 
 		 164 aa  297  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  82.32 
 
 		 164 aa  296  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  76.83 
 
 		 164 aa  285  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  70.7 
 
 		 167 aa  239  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  65.24 
 
 		 164 aa  238  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  68.15 
 
 		 167 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  67.52 
 
 		 167 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  61.59 
 
 		 164 aa  222  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  56.1 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  47.53 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  36.05 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  34.97 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 		 184 aa  90.5  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  34.72 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  34.03 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 		 191 aa  87  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  34.97 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  34.9 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  34.9 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  33.94 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  33.57 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  34.04 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  34.93 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  31.94 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  30.99 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  31.39 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  31.91 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  34.04 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  33.99 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  33.99 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  34.19 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  35.14 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  31.17 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  28.83 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  33.81 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  29.87 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  30.26 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  35.46 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  29.93 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  30.52 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  31.11 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  31.11 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  30.52 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  29.22 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  31.79 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  30.13 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  30.32 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  32.17 
 
 		 275 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  32.03 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  31.76 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  38.67 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  28.28 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  31.82 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.08 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  28.93 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  31.37 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  28.97 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  28.89 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  26.92 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  30.08 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  31.76 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  26.97 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  28.38 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  29.75 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  29.22 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  27.92 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.89 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.72 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.19 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  25.93 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  28.15 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  31.08 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  29.69 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  25.66 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  27.08 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  26.95 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>