131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2196 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
164 aa  341  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  90.18 
 
 
164 aa  315  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  88.89 
 
 
164 aa  307  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  85.8 
 
 
164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  84.66 
 
 
164 aa  299  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  80.98 
 
 
164 aa  294  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  82.1 
 
 
165 aa  288  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  65.85 
 
 
167 aa  240  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  64.42 
 
 
164 aa  237  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  64.02 
 
 
167 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  62.8 
 
 
167 aa  228  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  62.58 
 
 
164 aa  227  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  58.9 
 
 
171 aa  198  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  50 
 
 
167 aa  134  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  36.24 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 
181 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  35.62 
 
 
181 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  34.72 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  34.03 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  35.76 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  35.66 
 
 
176 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  35.76 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  34.73 
 
 
176 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  33.77 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  32.87 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
191 aa  84.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
194 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  34.44 
 
 
179 aa  84  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
174 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  31.51 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  30.28 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  32.12 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  34.48 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  35.95 
 
 
194 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  33.99 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  33.99 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  36.49 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  31.51 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  31.21 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  32.7 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  29.94 
 
 
183 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  31.01 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 
167 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  31.17 
 
 
183 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  30.38 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  35.46 
 
 
190 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  28.08 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  28.38 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  30.95 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  26.49 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  38.89 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.88 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  33.78 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.08 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  30.43 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  28.38 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  28.48 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  24.82 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  32.31 
 
 
156 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  33.09 
 
 
154 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  27.03 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  26.53 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.2 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.28 
 
 
275 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  29.68 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  31.29 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  25.81 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  37.68 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.67 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  27.4 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  28.36 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  29.8 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  30.32 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  27.81 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  37.04 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  32.37 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  25.87 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  27.15 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.57 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  28.67 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  25.37 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  29.93 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  27.59 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  26.87 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  29.33 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  25.87 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>