34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1498 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  95.08 
 
 
183 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  92.35 
 
 
183 aa  362  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  86.34 
 
 
183 aa  342  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  76.92 
 
 
183 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  77.05 
 
 
182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  77.05 
 
 
182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  57.87 
 
 
188 aa  217  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  55.62 
 
 
194 aa  208  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  52.38 
 
 
195 aa  177  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  29.63 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1245  hypothetical protein  62.26 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  30.82 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.82 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  29.3 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  28.1 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  31.4 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  28.1 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  31.01 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  31.01 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.81 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  31.17 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  29.22 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  28.76 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  28.76 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  27.63 
 
 
151 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  27.33 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  27.21 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  24.83 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>