81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2218 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
151 aa  303  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  67.55 
 
 
151 aa  213  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  67.55 
 
 
167 aa  206  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  61.7 
 
 
148 aa  173  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  54.11 
 
 
172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  50 
 
 
165 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  47.95 
 
 
170 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  35.66 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  31.62 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.15 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  30.37 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  31.34 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  29.5 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  26.49 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  31.11 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  27.15 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  28.78 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  27.46 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  26.49 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  28.78 
 
 
181 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  28.78 
 
 
181 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  33.08 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  26.71 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  29.58 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  30.99 
 
 
195 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  30.15 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  26.87 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  27.33 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  27.21 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.82 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  28.68 
 
 
191 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  26.09 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  25 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  27.82 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  25.71 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  27.07 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  27.33 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  26.28 
 
 
179 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  29.86 
 
 
192 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  27.07 
 
 
160 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
188 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  26.03 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  27.21 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  24.14 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  24.14 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  26.32 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  27.59 
 
 
183 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  23.36 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  25.71 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  26.32 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  25.37 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  27.21 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  25.37 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  23.36 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  26.52 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  27.48 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  24.09 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  27.82 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  28.57 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  25 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  25.56 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  25.56 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  27.21 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  28.99 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  25 
 
 
176 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  28.36 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  23.88 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  27.7 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  25.81 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  23.97 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  24.81 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  28.04 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>