73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0104 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  88.02 
 
 
167 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  87.43 
 
 
167 aa  309  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  71.17 
 
 
164 aa  259  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  65.85 
 
 
164 aa  240  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  70.7 
 
 
164 aa  239  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  66.87 
 
 
164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  66.67 
 
 
165 aa  233  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  63.8 
 
 
164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  62.58 
 
 
164 aa  228  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  61.35 
 
 
164 aa  228  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  62.58 
 
 
164 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  55.69 
 
 
171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  53.75 
 
 
167 aa  142  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  34.93 
 
 
184 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
194 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  34.23 
 
 
161 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  32.87 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  31.91 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  31.72 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  31.72 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  35.42 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  29.73 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  30.46 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.99 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  30.82 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  29.93 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  28.28 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  30.14 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  30.82 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  37.58 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  31.72 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  32.62 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  33.77 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  33.77 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  28.76 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  29.41 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  27.78 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  31.01 
 
 
183 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  29.75 
 
 
183 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  26.49 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  33.33 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  25.83 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  27.95 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  27.15 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5174  Ferritin Dps family protein  25.32 
 
 
144 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  27.74 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  37.84 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.08 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.87 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  28.99 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  28.48 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  24.5 
 
 
144 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  26.12 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  26.57 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  26.47 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>