175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02642 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  76.57 
 
 		 191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  62.57 
 
 		 176 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  62.57 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  62.57 
 
 		 176 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  63.25 
 
 		 168 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  57.38 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  57.54 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  61.08 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  61.99 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  61.4 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  56.42 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  56.74 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  58.24 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  58.68 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  56.47 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  59.51 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  55.17 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  56.18 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  52.35 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  54.72 
 
 		 194 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  52.94 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  52.94 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  55.32 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  51.18 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  52.15 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  51.76 
 
 		 257 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  43.79 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  33.08 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.28 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  30.99 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  30.07 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  30.34 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  30.99 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  28.28 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  29.32 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.09 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  29.71 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  27.66 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  26.95 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  35.25 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  33.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  26.24 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  28.99 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  28.47 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  32.62 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.37 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  26.87 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  29.63 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  29.1 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  29.63 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  31.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  31.91 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  30.15 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  29.63 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  30.37 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.21 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  30.94 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  30.15 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  31.3 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  29.41 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  29.71 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  26.67 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  29.85 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  29.85 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  29.41 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  28.15 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  28.57 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  30.6 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  31.65 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  30.3 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  29.71 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  29.63 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  31.65 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  27.82 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  25.34 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  30.53 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  27.41 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  31.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  30.66 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  27.41 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  28.47 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  29.41 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  28.15 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  29.63 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  26.87 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>