261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1369 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  62.34 
 
 
155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  62.34 
 
 
155 aa  208  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  61.69 
 
 
155 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  62.99 
 
 
155 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  62.34 
 
 
155 aa  205  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  61.04 
 
 
155 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  61.04 
 
 
155 aa  204  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  62.99 
 
 
155 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  62.99 
 
 
155 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  60.39 
 
 
155 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  61.04 
 
 
155 aa  203  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  58.44 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  55.19 
 
 
155 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  58.44 
 
 
156 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  56.86 
 
 
161 aa  183  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  59.09 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  61.69 
 
 
154 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  59.74 
 
 
154 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  57.79 
 
 
155 aa  178  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  55.84 
 
 
157 aa  177  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  61.04 
 
 
154 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  60.39 
 
 
154 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  60.39 
 
 
154 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  55.84 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  57.14 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  59.74 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  53.9 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  59.74 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  59.74 
 
 
154 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  56.69 
 
 
162 aa  169  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  54.09 
 
 
161 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  58.17 
 
 
155 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  51.3 
 
 
161 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  56.05 
 
 
162 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  52.6 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  56.77 
 
 
159 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  54.78 
 
 
159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  55.41 
 
 
158 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  54.19 
 
 
160 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  50.32 
 
 
156 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  54.19 
 
 
160 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  54.43 
 
 
162 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  49.35 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  49.68 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  49.04 
 
 
158 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  52.87 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  47.44 
 
 
159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  48.05 
 
 
157 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  47.13 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  47.13 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  47.74 
 
 
158 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  46.5 
 
 
157 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  46.5 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  47.4 
 
 
158 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  43.87 
 
 
158 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  45.86 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  46.75 
 
 
172 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  46.1 
 
 
158 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  46.5 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  46.5 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  44.59 
 
 
157 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  44.44 
 
 
154 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  45.22 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  45.22 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  44.94 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  45.22 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  45.22 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  45.22 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  46.15 
 
 
159 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  46.15 
 
 
159 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  46.79 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  46.15 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  44.87 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  44.59 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  47.71 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  46.79 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  44.16 
 
 
159 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  44.81 
 
 
159 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  42.21 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  42.21 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  43.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  43.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  43.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  44.87 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  44.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  43.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  43.59 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  42.21 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  42.21 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  44.23 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  44.23 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  46.5 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  42.95 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  44.23 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  42.68 
 
 
156 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  40.13 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>