241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5052 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  86.93 
 
 		 154 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  86.27 
 
 		 154 aa  279  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  81.7 
 
 		 154 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  81.7 
 
 		 154 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  81.7 
 
 		 154 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  81.05 
 
 		 154 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  79.61 
 
 		 154 aa  256  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  79.61 
 
 		 154 aa  256  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  69.03 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  67.97 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  66.67 
 
 		 154 aa  213  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  68.42 
 
 		 165 aa  209  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  64.52 
 
 		 160 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  64.52 
 
 		 160 aa  204  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  60.65 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  61.29 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  63.82 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  65.1 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  60.53 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  59.74 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  59.62 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  59.48 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  58.82 
 
 		 155 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  60.13 
 
 		 155 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  59.48 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  57.79 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  59.48 
 
 		 155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  58.82 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  59.48 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  58.82 
 
 		 155 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  59.09 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  58.17 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  58.17 
 
 		 155 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  58.17 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  57.14 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  56.21 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  58.17 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  55.84 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  54.9 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  56.77 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  57.52 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  52.56 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  50.98 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  50.32 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  49.02 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  48.05 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  48.7 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  49.35 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  48.72 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  47.71 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  48.37 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  44.23 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  48.05 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  49.02 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  49.02 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  48.05 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  47.4 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  47.4 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  48.37 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  46.1 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  46.75 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  46.41 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  46.41 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  45.45 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  46.1 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  46.1 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  46.1 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  46.75 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  48.7 
 
 		 180 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  44.59 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  45.51 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  44.81 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  48.05 
 
 		 224 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  45.75 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  44.81 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  44.23 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  47.71 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  45.45 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  46.75 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>