244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2757 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  82.28 
 
 
160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  82.28 
 
 
160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  73.55 
 
 
159 aa  237  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  72.05 
 
 
162 aa  234  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  69.48 
 
 
165 aa  221  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  66.23 
 
 
154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  66.88 
 
 
154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  63.64 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  63.64 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  63.82 
 
 
155 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  58.71 
 
 
155 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  57.69 
 
 
159 aa  181  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  56.96 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  57.42 
 
 
155 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  57.69 
 
 
156 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  56.33 
 
 
162 aa  177  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  56.77 
 
 
155 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  56.77 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  56.13 
 
 
155 aa  176  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  55.48 
 
 
155 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  55.48 
 
 
155 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  54.84 
 
 
155 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  55.48 
 
 
155 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  56.77 
 
 
155 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  54.84 
 
 
155 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  54.84 
 
 
155 aa  173  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  54.14 
 
 
161 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  54.49 
 
 
157 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  55.48 
 
 
155 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  55.62 
 
 
161 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  53.85 
 
 
161 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  54.84 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  55.41 
 
 
159 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  56.77 
 
 
155 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  51.61 
 
 
155 aa  156  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  48.72 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  51.25 
 
 
161 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  46.5 
 
 
156 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  46.5 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  45.86 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  45.86 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  47.74 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  45.22 
 
 
157 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  46.5 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  46.5 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  47.13 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  45.28 
 
 
158 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  45.28 
 
 
158 aa  124  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  45.28 
 
 
158 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  45.28 
 
 
158 aa  124  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  45.28 
 
 
158 aa  124  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  45.81 
 
 
154 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  44.59 
 
 
157 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  44.59 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  45.22 
 
 
157 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  45.62 
 
 
159 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  43.4 
 
 
158 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  120  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  43.23 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  44.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  44.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  44.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  44.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  44.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  43.87 
 
 
157 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  42.58 
 
 
159 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  44.03 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  40.79 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  42.04 
 
 
157 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  42.04 
 
 
157 aa  116  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  41.98 
 
 
158 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  43.21 
 
 
180 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  42.41 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  43.04 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  42.41 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  43.21 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  44.16 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  43.95 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  42.04 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  43.23 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  46.45 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>