259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0958 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  86.45 
 
 		 155 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  88.39 
 
 		 155 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  87.1 
 
 		 155 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  87.1 
 
 		 155 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  87.1 
 
 		 155 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  87.1 
 
 		 155 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  85.81 
 
 		 155 aa  273  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  85.16 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  85.81 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  85.81 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  79.35 
 
 		 155 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  79.35 
 
 		 155 aa  255  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  78.71 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  80 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  62.34 
 
 		 159 aa  208  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  61.29 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  61.94 
 
 		 155 aa  197  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  57.42 
 
 		 160 aa  190  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  56.77 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  60.65 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  58.71 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  56.13 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  58.06 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  60 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  59.48 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  58.06 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  58.06 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  55.48 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  56.13 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  56.13 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  56.13 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  56.13 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  56.13 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  56.13 
 
 		 154 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  54.19 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  56.49 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  54.84 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  54.55 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  54.55 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  53.55 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  54.19 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  51.61 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  52.26 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  53.55 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  49.68 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  49.68 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  49.03 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  50.97 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  49.68 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  49.03 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  49.03 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  48.39 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  47.44 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  48.39 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  49.03 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  49.03 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  45.39 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  47.74 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  47.74 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  47.1 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  47.74 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  48.05 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  47.4 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  47.74 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  47.74 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  45.81 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  41.94 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  47.1 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  46.45 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2873  bacterioferritin  46.45 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  44.52 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  42.67 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  47.1 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>