294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2231 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  62.58 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  58.71 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  58.71 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  58.71 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  60.65 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  57.42 
 
 		 155 aa  197  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  56.13 
 
 		 155 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  57.42 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  58.06 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  55.48 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  63.87 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  56.77 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  57.42 
 
 		 155 aa  190  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  57.05 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  54.19 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  55.41 
 
 		 157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  56.77 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  57.32 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  57.32 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  51.61 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  55.41 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  56.77 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  54.78 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  52.6 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  55.48 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  55.48 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  55.48 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  54.84 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  50.32 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  51.59 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  46.88 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  51.92 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  50.97 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  48.73 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  52.56 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  48.41 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  48.41 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  49.37 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  51.25 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  49.37 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  48.73 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  49.07 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  49.07 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  47.47 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  49.07 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  48.39 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  49.03 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  48.72 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  46.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  46.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  46.5 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  45.4 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  48.45 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  44.79 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  46.88 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  46.88 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  44.44 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  46.25 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  49.03 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  45.91 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  45.62 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  43.87 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  45 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  45.91 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  46.84 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  45.91 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  44.65 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  47.47 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  48.1 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  44.38 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  43.75 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  44.03 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  47.74 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  43.75 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  42.58 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  45.16 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  43.51 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  45.68 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  45 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  42.86 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  43.4 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  41.25 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  41.29 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  44.17 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  44.3 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>