264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2873 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2873  bacterioferritin  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3608  bacterioferritin  77.42 
 
 		 156 aa  229  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  71.61 
 
 		 156 aa  226  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0932  bacterioferritin  74.52 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0990  bacterioferritin  79.87 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000039605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3555  bacterioferritin  73.89 
 
 		 157 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3358  bacterioferritin  73.89 
 
 		 157 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000472947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3430  bacterioferritin  73.25 
 
 		 157 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0948  bacterioferritin  74.68 
 
 		 157 aa  221  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.811124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  76.77 
 
 		 156 aa  222  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  74.68 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  74.68 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0946  bacterioferritin  74.68 
 
 		 157 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  74.68 
 
 		 157 aa  220  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0957  bacterioferritin  75.97 
 
 		 156 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.147551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  67.53 
 
 		 154 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3095  bacterioferritin  79.87 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.420801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  66.89 
 
 		 159 aa  204  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  62.99 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  60.51 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  60.51 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  60.13 
 
 		 172 aa  192  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  61.29 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  60.65 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  58.6 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  59.09 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  59.87 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  59.24 
 
 		 157 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  59.09 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  66.88 
 
 		 545 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  59.09 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  58.06 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  57.32 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  57.96 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  57.79 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  60 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  57.96 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  57.96 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  57.32 
 
 		 159 aa  180  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  59.74 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  59.74 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  56.49 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  56.69 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  57.42 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  56.69 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  58.06 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  56.69 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  55.56 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  56.49 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  58.97 
 
 		 224 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  56.77 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  56.49 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  57.42 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  57.42 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  55.41 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  58.33 
 
 		 180 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  55.84 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  57.42 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  58.33 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  57.05 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  56.49 
 
 		 157 aa  176  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  56.49 
 
 		 157 aa  176  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  56.77 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  55.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  55.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  54.78 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  55.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  55.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  55.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  55.19 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  57.05 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1168  bacterioferritin, subunit 2  58.44 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2113  bacterioferritin  53.5 
 
 		 157 aa  175  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  57.05 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  55.41 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  55.84 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  56.41 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  56.41 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  56.41 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  56.41 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  58.55 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  55.84 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  56.49 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  57.05 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  56.49 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  56.41 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  56.41 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  55.19 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  53.85 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  55.84 
 
 		 159 aa  169  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  53.85 
 
 		 159 aa  170  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>