52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1742 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  79.87 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  77.27 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  77.85 
 
 		 156 aa  240  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  60.26 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  62.42 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  57.66 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  57.66 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  53.19 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5174  Ferritin Dps family protein  53.19 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  53.19 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  53.19 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  50.35 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  49.65 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  49.32 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  30.36 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  25.5 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  28.97 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  27.66 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  25.34 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  27.78 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  26.57 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  26.76 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  26.76 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  25.35 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  25.87 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  28.32 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  24.78 
 
 		 275 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  26.06 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  26.06 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  25.52 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  25.56 
 
 		 161 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  39.62 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  27.69 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  25.35 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  24.52 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  24.48 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  30.69 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  29.7 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  29.7 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.08 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>