142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0955 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  86.91 
 
 		 275 aa  494  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  85.09 
 
 		 275 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  33.45 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  34.39 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  38.52 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  33.07 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  34.78 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  34.78 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  30.77 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  31.16 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  32.61 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  36.22 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  31.88 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  32.82 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  31.88 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  33.09 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  33.33 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  35.51 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  32.09 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  34.13 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  33.82 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  33.82 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  31.3 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.94 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  32 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  34.13 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  36 
 
 		 160 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  34.13 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  34.13 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  31.88 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  34.92 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  34.13 
 
 		 161 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 196 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.8 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.75 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  33.1 
 
 		 164 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  32 
 
 		 160 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 		 174 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  32.06 
 
 		 159 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  32.31 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  34.13 
 
 		 161 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  33.33 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  34.4 
 
 		 165 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  27.78 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  27.04 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  30.16 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  30.23 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  30.43 
 
 		 179 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  28.08 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 142 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 		 138 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  32.54 
 
 		 161 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 165 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  30.16 
 
 		 159 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  34.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.75 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  32.54 
 
 		 165 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  34.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  33.59 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  33.06 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.4 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  32 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.54 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  31.17 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  33.86 
 
 		 155 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  32.8 
 
 		 165 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  32.54 
 
 		 165 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  33.6 
 
 		 165 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  29.58 
 
 		 164 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  30.47 
 
 		 160 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  24.78 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  33.08 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  29.58 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  31.54 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  32.31 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  32.14 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  25.66 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  31.3 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  32.09 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  30 
 
 		 158 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>