257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4856 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  100 
 
 		 168 aa  343  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  99.4 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  97.02 
 
 		 176 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  95.83 
 
 		 176 aa  332  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  86.31 
 
 		 179 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  85.12 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  83.33 
 
 		 180 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  73.81 
 
 		 177 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  73.21 
 
 		 177 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  67.88 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  68.48 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  67.88 
 
 		 185 aa  239  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  67.07 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  65.87 
 
 		 181 aa  235  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  64.07 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  64.29 
 
 		 181 aa  224  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  63.25 
 
 		 186 aa  217  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  65.27 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  63.47 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  60.98 
 
 		 184 aa  204  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  59.39 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  59.01 
 
 		 194 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  60.13 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  60.49 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  60.49 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  53.29 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  56.17 
 
 		 257 aa  187  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  48.48 
 
 		 187 aa  161  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  36.71 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  35.86 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  33.77 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  35.42 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  34.04 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  31.29 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  32.86 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  32.85 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  31.39 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  32.35 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.59 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  37.33 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  30.6 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  30.6 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.84 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  30.6 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  33.09 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  31.34 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  37.78 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  31.88 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  32.35 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  36.96 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  30.6 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  30.6 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  37.04 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  31.85 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  32.35 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  32.35 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  32.59 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  34.31 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  32.59 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  25.87 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  25.87 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  33.1 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  32.09 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  35.77 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  29.85 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  31.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  29.85 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  30.22 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  31.34 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  31.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  32.84 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  30.88 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  28.89 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  32.84 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  30.28 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  31.85 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  30 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.39 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  28.89 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  35.04 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  35.04 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  28.36 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  29.37 
 
 		 275 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  32.59 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  29.63 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>